案例分析题某县工商局根据群众举报，于2006年3月6日查获某种子公司准备销售的涉嫌劣质棉种2500公斤，其购进价为4元/公斤，计货款为10000元。经鉴定，该批棉种发芽率低，属劣质种子。该县工商局依据《产品质量法》的规定，对该种子公司作出了没收2500公斤棉种、罚款20000元的处罚决定。该种子公司因经营亏损、资金困难，向县工商局提出减免罚款10000元的申请，经县工商局研究决定，同意减免该公司10000元罚款。

应该怎样处理，才合法正确？