某门窗公司2010年承揽一家房地产企业门窗制作安装业务，总价款为1200万元，购进材料的进项税额为90万元，合同中约定安装价款为500万元。该门窗公司分别开具700万元的货物销售发票和500万元的建筑业发票给房地产企业，但未分别核算应税劳务的营业额和货物的销售额。近日，国税机关在例行纳税检查时，按常规安装费用占总价款的30%推算，认定这家门窗公司有虚增建筑业营业额的嫌疑，核定该公司货物销售额为840万元，但当地地税机关仍坚持按发票金额征收营业税。该公司想知道应如何进行税务处理？